Системата WCS отговаря за планирането между системата и оборудването и изпраща командите, издадени от системата WMS към всяко оборудване за координирана работа. Има непрекъсната комуникация между оборудването и WCS системата. Когато оборудването изпълни задачата, WCS системата автоматично извършва публикуване на данни с WMS системата.